Identificación de Cultivares y Líneas de Mejoramiento de Arroz de Chile Mediante Amplificación de Fragmentos Polimórficos (AFLP) Translated title: Identification of Chilean Rice Cultivars And Breeding Lines by Means of Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)

Abstract

Doce cultivares y líneas de arroz (Oryza sativa L.) desarrollados por el programa de fitomejoramiento del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu, fueron caracterizados genéticamente mediante amplificación de fragmentos polimórficos (AFLP). De 21 combinaciones ensayadas, sólo 16 fueron informativas, generando un total de 667 amplicones, 94 de ellos polimórficos (14,4%), con un rango entre 9 y 33% de polimorfismo por combinación. Esto indica que el material manejado por el programa de INIA presenta un bajo nivel de diversidad genética comparado tanto con germoplasma silvestre de la especie como con aquel usado por otros programas de fitomejoramiento de la especie. Los amplicones polimórficos detectados se usaron para preparar un dendrograma de distancias genéticas, detectándose cuatro grupos diferenciablesque sólo coinciden parcialmente con la información disponible de sus pedigrís. A pesar de la baja diversidad genética detectada, se determinó que con el uso de tres combinaciones de partidores de AFLP+3 (PE1G/PM1I, PE1H/PM1A y PE1G/PM1H) es posible discriminar entre los cultivares estudiados.

Translated abstract

Twelve rice (Oryza sativa L.) cultivars and breeding lines developed by the Rice Breeding Program at the National Institute of Agriculture Research (INIA),Quilamapu Regional ResearchCenter, were genetically characterized by amplified fragment length polymorphism (AFLP). Sixteen of 21 primer combinations evaluated were informative, generating a total of 667 amplicons, 94 of them polymorphic (14.4%), with a range between 9 to 33% of polymorphism per primer combination. This indicates that the material handled by the breeding program at INIA has low genetic diversity in comparison to wild germplasm of the species, or even compared to the material managed by other rice breeding programs. The detected polymorphic amplicons were used to prepare a dendrogram of the genetic distances, detecting four differentiable groups that only partially coincide with the information available in their pedigrees. In spite of the low genetic diversity detected, it was determined that with the use of three AFLP+3 combinations (PE1G/PM1I, PE1H/PM1A and PE1G/PM1H), it is possible to differentiate among the cultivars studied.