Mutations in the pfmdr1, cg2, and pfcrt genes in Plasmodium falciparum samples from endemic malaria areas in Rondonia and Pará State, Brazilian Amazon Region Translated title: Mutações nos genes pfmdr1, cg2 e pfcrt em isolados de Plasmodium falciparum provenientes de localidades malarígenas dos Estados de Rondônia e Pará, Amazônia Legal Brasileira

Abstract

The objectives of this study were to investigate the molecular basis for Plasmodium falciparum resistance to chloroquine in isolates from the Brazilian Amazon and to identify polymorphisms in the pfmdr1 gene, codons 184, 1042, and 1246, the kappa and gamma regions of the cg2 gene, and the K76T mutation of the pfcrt gene, in order to calculate the distribution of polymorphism within each target gene, comparing samples from distinct geographic areas, using allele-specific polymerase chain reaction (PCR) for the pfmdr gene and PCR plus restriction fragment length polymorphism (RFLP) for the cg2 and pfcrt genes. The sample consisted of 40 human blood isolates, already collected and morphologically diagnosed as carriers of P. falciparum parasites, from four localities: Porto Velho in Rondonia State and Maraba, Itaituba, and Tailandia in Pará State. Distribution of P. falciparum in vitro chloroquine resistance in the isolates was 100% for pfmdr1, cg2 gamma region, and pfcrt, except for the polymorphism in the cg2 kappa region, which was not found.

Translated abstract

O estudo foi desenvolvido para investigar a base molecular da resistência do Plasmodium falciparum à cloroquina em isolados da região Amazônica brasileira e identificar os polimorfismos nos códons TYR184PHE, ASN1042ASP e ASP1246TYR do gene pfmdr1, as regiões kappa e gamma do gene cg2 e a mutação K76T do gene pfcrt, a fim de determinar a distribuição percentual dos alelos de cada gene estudado, comparando amostras de áreas geográficas distintas, utilizando a reação em cadeia da polimerase (PCR) alelo-específica para o pfmdr1 e a PCR e o polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição (RFLP) para os genes cg2 e pfcrt. A amostra foi constituída de quarenta isolados de sangue humano já coletados e microscopicamente diagnosticados com malária por P. falciparum das localidades de Porto Velho (Rondônia) e Marabá, Itaituba e Tailândia (Pará). A distribuição percentual da resistência in vitro do P. falciparum à cloroquina nas amostras estudadas foi de 100% de resistência para os genes pfmdr1, região gamma do cg2 e pfcrt. O polimorfismo na região kappa do gene cg2 não foi encontrado nas amostras estudadas.