Optimized identification of microorganisms directly from positive blood cultures by MALDI-TOF to improve antimicrobial treatment Translated title: Optimización en el proceso de identificación directamente de hemocultivos positivos por MALDI-TOF para mejorar el tratamiento antimicrobiano

Abstract

Introduction

Bacteriemia is a major cause of morbidity and mortality among hospitalized patients worldwide. Early identification of microorganisms from blood culture can lead to improvement of treatment and outcomes.

Methods

The study was divided into two phases. The first phase when a comparison of the methods was made to check the concordance between them, using as a reference the standard method implemented in the laboratory. In a second phase, both methods are combined. We used the rapid identification method and when it could not identify we used the standard method. The microorganisms that were not identified by either of the two methods were identified from colony at 24 hours

Results

A total of 589 microbial positive blood cultures have been included in the present study. With the rapid method we obtained 96% and 88% identification results for Gram-negative bacilli (GNB) and Gram-positive cocci (GPC) respectively. In this study we observed that the combination of the rapid and standard method achieved identifications of 98% and 97% for GNB and GPC respectively.

Conclusions

The data analysed shows that both methods combined perform better than individually. We achieved an optimization of the identification of microorganisms directly from positive blood cultures by MALDI-TOF. This combination identified 98% of the microorganisms in between ten minutes to one hour and a half since the blood culture flagged positive.

Translated abstract

Introducción

La bacteriemia es una de las principales causas de morbilidad y mortalidad entre los pacientes hospitalizados de todo el mundo. La identificación temprana de los microorganismos que están en la sangre, permite optimizar los tratamientos y conseguir mejores resultados.

Material y métodos

El estudio se dividió en dos fases. En la primera fase se realizó una comparación de los dos métodos para comprobar la concordancia entre ambos, tomando como referencia el método estándar implementado en el laboratorio. La segunda fase combinó ambos métodos para la identificación de hemocultivos positivos. Se utilizó el método de identificación rápida como primera opción y el método estándar solo cuando no se consiguió identificar por la primera opción. Los microorganismos que no fueron identificados por ninguno de los dos métodos, se identificaron directamente de la colonia crecida a las 24 horas.

Resultados

Se analizaron un total de 589 hemocultivos positivos en este estudio. Con el método rápido obtuvimos un 96% y 88% de identificación de bacilos gramnegativos y cocos grampositivos respectivamente. En este estudio observamos que la combinación del método rápido y el método estándar consiguió identificaciones del 98% y 97% para bacilos gram-negativos y cocos grampositivos respectivamente.

Conclusiones

Los datos analizados muestran que ambos métodos combinados consiguen mejores resultados que utilizados de forma individual. Logramos una optimización de la identificación de microorganismos directamente a partir de hemocultivos positivos por MALDI-TOF. Con esta combinación se identificó el 98% de los microorganismos entre los primeros 10 minutos y hora y media de hemocultivo positivo.